Die Forschungsschwerpunkte im Fachgebiet Tiergesundheit und Veterinary Public Health werden durch den Forschungsbedarf geprägt, welcher sich aus der Tiergesundheitsstrategie Schweiz 2010+ und dem Teilprojekt Tier der Strategie zur Bekämpfung von Antibiotikaresistenzen StAR ergeben. Der Fokus liegt hierbei auf international bekämpften Tierseuchen und Zoonosen sowie auf wirtschaftlich relevanten Krankheiten infektiösen Ursprungs. Zudem gewinnen neu- und wiederauftretende Tierseuchen, bedingt durch den Klimawandel, die zunehmende Migration und dem steigenden globalen Reise- und Warenverkehr, an Bedeutung.
Das BLV überwacht zusammen mit den Kantonen das Auftreten von Tierseuchen und Zoonosen. Jahr für Jahr werden Nutztiere beprobt und auf mehrere Krankheiten untersucht. Dadurch sollen sichere Lebensmittel gewährleistet, die Gesundheit von Mensch und Tier gefördert sowie optimale Voraussetzungen für den internationalen Handel geschaffen werden.